El IICSAL tiene como propósito principal facilitar la articulación y la ejecución de programas y proyectos de investigación de la FLACSO Argentina, dándole particular importancia a los proyectos interdisciplinarios que combinen áreas y programas de la institución y que vinculen a ésta con redes nacionales e internacionales (Reglamento interno. Artículo 2).

El IICSAL busca y propone como gran tema transversal el de la “Desigualdad Social y el Desarrollo” a través de sus distintas acepciones como la del desarrollo económico, estratégico, sostenible y/o desarrollo humano.

Bajo este gran tema de referencia se acobijan distintas problemáticas que apelan al perfil tradicional de la FLACSO Argentina que es el de analizar los fenómenos sociales desde una perspectiva latinoamericana y de política pública, tanto a nivel global, regional, nacional y subnacional.